Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMG1C9JSJ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms