Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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C4orf47A7E2U8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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C4orf47A7E2U8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4orf47A7E2U8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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