Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3CA6NKF2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3CA6NKF2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms