Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX2A2RU54 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms