Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms