Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms