Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms