Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms