Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms