Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms