Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms