Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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FOXQ1Q9C009 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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FOXQ1Q9C009 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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