Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms