Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478 ms