Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms