Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARXQ96QS3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms