Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF496Q96IT1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms