Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMIM12Q96EX1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMIM12Q96EX1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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