Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms