Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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GDPD1Q8N9F7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GDPD1Q8N9F7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GDPD1Q8N9F7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDPD1Q8N9F7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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