Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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