Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOM1L2Q6ZVM7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms