Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN8

CLEC9A, C-type lectin domain family 9 member A, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC9AQ6UXN8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLEC9AQ6UXN8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC9AQ6UXN8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms