Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN1Q6UXK5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN1Q6UXK5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms