Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms