Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT6Q5T7P8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms