Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms