Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms