Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACKR1Q16570 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms