Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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