Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NSRP1-216ENST00000589608 368 ntTSL 56.29□□□□□ -1.46e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-212ENST00000584317 564 ntTSL 56.27□□□□□ -1.416e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-215ENST00000588614 497 ntTSL 26.2□□□□□ -1.426e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-204ENST00000475652 1242 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.576e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-214ENST00000585881 582 ntTSL 33.06□□□□□ -1.926e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 WWTR1-209ENST00000479238 697 ntTSL 318.43■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.26e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.386e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 38.12□□□□□ -1.119e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SCAF1-203ENST00000598359 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.79□□□□□ -0.365e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-204ENST00000602276 708 ntTSL 514.29□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-205ENST00000602438 576 ntTSL 412.71□□□□□ -0.374e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-206ENST00000602689 554 ntTSL 39.93□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 CTIF-205ENST00000587860 2940 ntTSL 214.65□□□□□ -0.067e-8■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 323.88■■□□□ 1.417e-16■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 318.75■□□□□ 0.597e-16■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ABCA7-206ENST00000525073 1918 ntTSL 220.79■□□□□ 0.923e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ABCA7-219ENST00000612569 876 ntTSL 315.78■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.87e-24■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 GDPD5-213ENST00000532435 825 ntTSL 520.89■□□□□ 0.933e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 319.55■□□□□ 0.723e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ZNF444-212ENST00000593100 562 ntTSL 219.53■□□□□ 0.723e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GDPD5-207ENST00000528031 724 ntTSL 215.67■□□□□ 0.13e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 214.94□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SHANK2-217ENST00000498519 510 ntTSL 312.53□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.556e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.653e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 LIG1-213ENST00000596672 792 ntTSL 39.72□□□□□ -0.853e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NDE1-210ENST00000574163 352 ntTSL 39.27□□□□□ -0.933e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.243e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RNF31-209ENST00000559071 1943 ntTSL 215.86■□□□□ 0.134e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.064e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RNF31-214ENST00000559449 808 ntTSL 512.68□□□□□ -0.384e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.654e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ERCC8-208ENST00000497892 881 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ERCC8-202ENST00000381118 2236 ntTSL 27.81□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ERCC8-205ENST00000477893 752 ntTSL 27.72□□□□□ -1.171e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ERCC8-203ENST00000439176 684 ntTSL 56.25□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.931e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SHC2-204ENST00000590113 632 ntTSL 59.93□□□□□ -0.828e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.376e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-204ENST00000435519 1306 ntTSL 227.31■■□□□ 1.962e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.872e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-202ENST00000414739 2007 ntTSL 1 (best)24.64■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 224.6■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-213ENST00000447825 896 ntTSL 322.25■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-211ENST00000543273 2840 ntTSL 1 (best)21.74■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-203ENST00000526521 745 ntTSL 319.71■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 319.6■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-206ENST00000538846 814 ntTSL 1 (best)19.27■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-203ENST00000453423 971 ntTSL 219.27■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-210ENST00000545838 532 ntTSL 219.19■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-209ENST00000466831 2191 ntTSL 218.88■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 FGFR4-213ENST00000511076 838 ntTSL 518.6■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABCF3-207ENST00000468892 1360 ntTSL 318.38■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-208ENST00000539651 545 ntTSL 418.3■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-204ENST00000586789 993 ntTSL 518.14■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-204ENST00000373945 763 ntTSL 217.57■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-203ENST00000586439 744 ntTSL 517.51■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BICDL1-202ENST00000546420 2397 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-207ENST00000441122 1134 ntTSL 517.4■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-201ENST00000328453 3526 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABCF3-214ENST00000480562 1182 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-206ENST00000423867 524 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-209ENST00000541349 1450 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SLC45A3-202ENST00000460934 2448 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.243e-12■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-202ENST00000367308 996 ntTSL 516.21■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-202ENST00000414148 360 ntTSL 515.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NCOR2-217ENST00000464377 499 ntTSL 215.59■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-207ENST00000406771 652 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 23.1
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