Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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