Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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