Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAMC2Q13753 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LAMC2Q13753 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms