Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAMB3Q13751 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms