Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTCH1Q13635 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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