Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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