Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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