Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD3Q12873 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD3Q12873 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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