Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN11Q06124 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms