Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHDQ02161 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms