Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA3P59666 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms