Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms