Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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