Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RGS4P49798 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RGS4P49798 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RGS4P49798 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RGS4P49798 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms