Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPZBP47756 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms