Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms