Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms