Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BMI1P35226 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BMI1P35226 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BMI1P35226 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BMI1P35226 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BMI1P35226 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BMI1P35226 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms