Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA5P28066 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA5P28066 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA5P28066 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA5P28066 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA5P28066 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms